Heiko Gäthje
Senior-Trainer, Trainingsakademie
Hallo, ich heiße Heiko Gäthje. Meine Erfahrung in der Weitfeld- und konfokalen Fluoreszenzmikroskopie und Bildverarbeitung von 3D-Daten begann mit der Arbeit als Biologe. Meine Schwerpunktbereiche waren die neuronale Entwicklung von Insekten und die Struktur von Sialinsäure-bindenden neuronalen Proteinen bei Säugetieren.
Heiko kam 2004 als Web-Content-Manager im Marketing- und Kommunikationsteam zu uns. Er unterstützt und führt Mikroskopie-Schulungen am EMBL Heidelberg und an der Zurich Winter School on Advanced Microscopy durch, wo er regelmäßig Fragen zur Bildverarbeitung und Bildanalyse beantwortet.
Webinare
Digitale Bildverarbeitung Teil 2: Erweiterte Bildverarbeitungsfilter
Heiko Gäthje - Donnerstag, 25 März, 2021
Senior-Trainer, Trainingsakademie
In unserem ersten Webinar zu diesem Thema haben wir gelernt, dass mit einem Lichtmikroskop aufgenommene Bilder nie ein perfektes Abbild unserer Proben sind. Es gibt immer Fehlerquellen. Da wir diese Fehler nur minimieren und nicht eliminieren können, müssen die Rohdaten eines Bildgebungsexperiments vor der endgültigen Bildanalyse oft digital verarbeitet werden.
Dekonvolution von 3D-Bildstapeln
Heiko Gäthje - Dienstag, 26 Oktober, 2021
Senior-Trainer, Trainingsakademie
Bilder, die mit einem Lichtmikroskop aufgenommen werden, sind niemals echte Darstellungen des Objekts. Fehlerquellen, die kontrolliert werden müssen, sind die Probenvorbereitung und Färbeprotokolle sowie optische Aberrationen und die Einschränkungen von Mikroskop und Digitalkamera.
Digitale Bildverarbeitung: Punkt- und lokale Operationsfilter (Encore-Edition)
Heiko Gäthje - Donnerstag, 29 Juli, 2021
Senior-Trainer, Trainingsakademie
Willst du digitale Bildverarbeitungstechniken besser verstehen? Dann schau dir am 29. Juli unser Webinar „Ask the Experts“ als Wiederholung an, in dem wir besprechen, wie Punkt- und lokale Filteroperationen genutzt werden können, um Fehlerquellen wie Rauschen oder niedrigen Kontrast in Mikroskopiebildern zu kontrollieren. Neben der Erkundung der Mathematik hinter Bildverarbeitungstechniken wie Segmentierung, Extraktion und Schwellenwertbildung wird unser Experte Heiko auch über die Ethik der Bildverarbeitung sprechen – damit du einschätzen kannst, ob bestimmte Techniken erlaubt sind.
Digitale Bildverarbeitung: Punkt- und lokale Operationsfilter
Heiko Gäthje - Donnerstag, 5 November, 2020
Senior-Trainer, Trainingsakademie
Bilder, die mit einem Lichtmikroskop aufgenommen werden, sind niemals echte Darstellungen des Exemplars; es gibt immer Fehlerquellen, die kontrolliert werden müssen. In diesem Webinar werden wir besprechen, wie man mit diesen Fehlerquellen umgehen kann.