Logiciel d’imagerie microscopique cellSENS

Offrant des opérations intuitives et un flux de travail sans faille, l’interface utilisateur du logiciel cellSens est personnalisable afin que vous puissiez contrôler la disposition. Proposé sous forme de différents forfaits, le logiciel cellSens offre une variété de fonctionnalités optimisées pour vos besoins spécifiques en imagerie. Ses fonctionnalités Graphic Experiment Manager et Well Navigator facilitent l’acquisition d’images en 5D. Obtenez une résolution améliorée grâce à la déconvolution TruSight™ et partagez vos images avec le mode de conférence.

Le logiciel cellSens n’est pas destiné à un usage de diagnostic clinique.

Logiciel d'imagerie cellSens

Fonctionnement intuitif. Processus de travail fluide.

La plateforme cellSens d’Evident vous permet de contrôler entièrement l’affichage et l’emplacement des icônes, des barres d’outils et des commandes. Vous pouvez donc faire évoluer et adapter le logiciel en fonction de vos besoins de recherche en constante évolution.

Télécharger la brochure

Packages cellSens

cellSens Entry

cellSens Entry est la pierre angulaire idéale pour les chercheurs qui souhaitent passer à l’acquisition et à la documentation d’image numérique, en proposant tous les outils nécessaires à une acquisition d’image simple.

cellSens Standard

Le cellSens Standard offre une acquisition au-delà d’une seule image, avec des processus de capture d’image avancés (p. ex. Time-lapse) et le contrôle de composants de microscopes motorisés et encodés.

cellSens Dimension

cellSens Dimension est le progiciel cellSens le plus polyvalent, doté d’une acquisition d’images entièrement automatisée, de puissants outils d’analyse, et d’une large gamme d’avantages supplémentaires.

Acquisition d’images en 5D

Acquérez des images en cinq dimensions à l’aide d’outils comme le Graphic Experiment Manager (GEM) et le Well Navigator qui vous aident à visualiser de façon conviviale votre acquisition de données.

Gestionnaire graphique d’expériences (GEM)

Dimension

Le GEM est une interface flexible de type glisser-déposer qui vous permet de créer des expériences simples ou complexes au sein du logiciel cellSens. Combinez des actions au sein de cadres spécialisés pour dicter l’ordre et la priorité de l’automatisation et interagir avec le système pendant des acquisitions à long terme en time-lapse, sans interrompre l’expérience. Pour accroître l’efficacité, vous pouvez définir des fonctions macro, telles que l’exécution du traitement de déconvolution dans le GEM.

Outil Process Manager

Dimension + Standard

Grâce au Process Manager, la saisie d’images multicanaux et par intervalles se fait facilement en quelques clics. L’imagerie à empilement en Z est également possible avec la licence du progiciel cellSens Dimension.

Dimension + Multiposition

Standard + Multiposition

Utilisez la solution Multiposition en option pour saisir des images multipoints et des images de grandes zones lors de l’utilisation d’une platine motorisée. Vous pouvez aussi parcourir votre échantillon en cliquant simplement sur un point dans une image au moyen de l’outil Stage Navigation.

Dimension + Multiposition + Navigateur de plaques multi-puits

Ce module scanne et acquiert automatiquement des images de plaques à puits au format standard et personnalisé. Toutes les images acquises, les positions d'échantillons ainsi que les commentaires des utilisateurs peuvent être enregistrés dans une base de données structurée pour un accès centralisé rapide. Appliquez des paramètres d’acquisition multidimensionnels uniques à un seul puits ou à plusieurs puits sélectionnés en une seule étape, afin de pouvoir réaliser plusieurs expériences dans une plaque de puits pour soutenir des protocoles complexes.

Base de données

Dimension + Database Core ou Database Client

Standard + Database Core ou Database Client

La solution Database Core vous permet de créer et de configurer des bases de données, de contrôler entièrement l’accès à celles-ci, et de les partager sur un réseau. De plus, un outil d’interrogation interactif vous permet de trouver facilement les images souhaitées, les propriétés d’image associées, les commentaires des utilisateurs et tous les fichiers connexes (p. ex. des tableurs). Pour vous aider à obtenir ce dont vous avez besoin, cet outil offre aussi un aperçu automatique des images trouvées. Grâce à la solution Database Client, vous pouvez facilement lire et écrire dans la base de données partagée à partir de diverses stations.

Dimension + Multiposition + Well Navigator +

Database Core ou Database Client

En association avec le Well Navigator, la solution Database améliore grandement l’efficacité de l’affichage et de l’analyse des images de plaques à puits comportant une grande quantité de données. Il suffit de cliquer sur les icônes pour accéder aux renseignements sur l’image, comme la date, le nom de fichier ou le numéro de plaque à puits. Toute sélection d’images saisies peut être affichée aux fins d’analyse approfondie. Ensemble, ces outils vous permettent de visualiser les images capturées et d’analyser en continu les images sélectionnées (à l’aide de commandes « Batch Macro » par lots) par l’intermédiaire de l’interface de plaque à puits.

Imagerie panoramique en temps réel

Dimension

Standard + Manual Process

Créez des assemblages d’images en temps réel grâce à la solution Manual Process. Cette solution vous permet de parcourir votre échantillon au moyen d’une platine manuelle pendant que le logiciel enregistre et assemble les images en temps réel, ce qui fournit une solution de rechange économique aux images de lames entières. .

Dimension + Multiposition

Standard + Multiposition

L’acquisition d’images de grandes zones est entièrement automatisée si on utilise le progiciel cellSens Dimension, une platine motorisée et la solution Multiposition en option. Lorsqu’elle est associée à une mise au point Z motorisée ou à un dispositif de maintien de la mise au point, comme notre technologie TruFocus™, cette fonction peut corriger les effets de la distorsion et de l’inclinaison de l’échantillon.

https://adobeassets.evidentscientific.com/content/dam/video/image/landing-directory/cellsen/cellSens_mia_e_480.mp4

EFI

Dimension

Standard + Manual Process

Créez une image mise au point unique à partir de plans d’image successifs tout en tournant la molette de mise au point à l’aide de la fonction d’imagerie à profondeur de champ étendue (Extended Focus Imaging, EFI). Un système d'entraînement motorisé de la mise au point automatise entièrement l'acquisition EFI. Des images composites EFI peuvent également être créées directement à partir de piles Z précédemment capturées.

Acquisition d’images HDR

Dimension

En saisissant automatiquement de nombreuses images à différentes expositions, la fonction HDR crée une image finale avec une gamme dynamique plus élevée que ce qui peut être obtenu avec une seule exposition. Ainsi, les signaux de faible intensité sont clairement visibles, et les zones claires de l’échantillon ne sont pas surexposées.

Traitement et partage d’images

Révélez les véritables données dans vos images grâce à la déconvolution TruSight et à d’autres techniques de traitement d’images. Partagez facilement vos résultats avec les autres au moyen du mode de conférence, ou glissez-déposez des données dans les rapports préconfigurés.

TruSight™ – puissant outil de déconvolution

Dimension

Le progiciel cellSens Dimension offre la correction en direct des images 2D brouillées pour la prévisualisation et l’acquisition d’images, ce qui améliore la mise au point des échantillons épais.

Dimension + CI Deconvolution

La solution Constrained Iterative Deconvolution applique les plus récents algorithmes pour améliorer la résolution, le contraste et l’étendue dynamique à une vitesse inégalée grâce au traitement GPU. Des algorithmes conçus spécialement pour l’utilisation avec FLUOVIEW™ et l’imagerie Olympus Super Resolution (OSR) fournissent des images claires et nettes grâce à des systèmes de pointe à fréquences d’images ultra-rapides et à haute sensibilité.

Lignée cellulaire : Lignée cellulaire du Cancer cervical humain (HeLa)*1
Immunomarquage : Coloration Hec1 (vert, Alexa Fluor-488), coloration de l’α-tubuline (rouge, Alexa Fluor-568), coloration DAPI (bleu)
Cellule HeLa mitotique dérivée d’un cancer cervical humain. Les fuseaux mitotiques et kinétochores sont colorées avec des anticorps a-tubuline (rouge) et anti-Hec1 (vert) , respectivement. Les chromosomes interagissent avec les microtubules constituant le fuseau mitotique via les kinétochores, une structure protéique assemblée sur la région centromérique des chromosomes.
Données d’images fournies avec l’aimable autorisation de : Département d’oncologie moléculaire, Institut du développement, du vieillissement et du cancer, Université de Tohoku, Masanori Ikeda et Kozo Tanaka

* Pour en savoir plus sur l’origine des cellules HeLa, consultez le site web suivant : henriettalacksfoundation.org.

Concentrez-vous sur ce qui est important

Dimension

Déterminez objectivement la meilleure mise au point à partir d’images multidimensionnelles, notamment des piles Z et des time-lapses, à l’aide de l’outil Best Focus Extraction. Cet outil est efficace pour créer des images en série temporelle avec la meilleure mise au point possible.

Visualisez les données tridimensionnelles sur un seul plan grâce aux projections d’intensité maximale, qui fusionnent les plans de la série Z en une seule image affichant tous les pixels les plus lumineux.

Collaboration en temps réel

Dimension

Standard

Utilisez le mode de conférence pour remplir l’écran avec des images dynamiques ou statiques à des fins de présentation et de collaboration. Des outils d’annotation graphique sont à votre disposition pour annoter les images sans avoir à quitter le mode de conférence, ce qui améliore l’efficacité du flux de travail et permet de gagner du temps.

Dimension + NetCam

Standard + NetCam

En utilisant les protocoles TCP/IP standards, la solution cellSens NetCam facilite le transfert d’images en direct et d’images enregistrées à travers un réseau pour l’enseignement, le mentorat ou la supervision. Même à l’extérieur du laboratoire, les collaborateurs ou superviseurs peuvent surveiller le travail depuis tout point sur le réseau, améliorant l’efficacité du laboratoire.

https://adobeassets.evidentscientific.com/content/dam/video/video/library/04-ConferenceMode_E_SD_Revised.mp4

Un autre point de vue

Dimension

Standard

Affichez les images côte à côte pour une comparaison précise, avec zoom et déplacement simultanés, permettant un traitement d’image plus rapide.

Dimension

Le mode de visualisation de vignettes permet d’afficher simultanément tous les ensembles de données multidimensionnels et ainsi de déceler plus facilement les mouvements subtils ou les événements.

Rapport de données simple

Dimension

Un outil pratique de génération de rapports associe des images et des métadonnées de mesure dans un modèle de rapport avec une opération de glisser-déposer simple. Ces rapports Microsoft Word*2 vous permettent de collaborer rapidement et facilement avec des collègues et de communiquer les résultats.

* 2 Nécessite Microsoft Word version 2010 ou ultérieure

Déconvolution spectrale

Dimension

Avec l’algorithme de déconvolution linéaire de cellSens Dimension, les fluorochromes qui se chevauchent dans leur spectre d’émission, comme GFP et YFP, peuvent être facilement séparés pour produire des images fluorescentes sans diaphonie. Cet outil de déconvolution peut également séparer un arrière-plan lié à l’autofluorescence.

Outils d’analyse puissants

Travaillez de façon dynamique avec vos images pour extraire le plus de données possible afin d’obtenir des résultats expérimentaux fiables. La technologie d’apprentissage profond TruAI du logiciel offre une analyse de segmentation améliorée. Utilisez le Macro Manager pour automatiser des flux de travaux entiers, couvrant l’analyse et la sauvegarde des images.

Vert : Vous pouvez constater que la détection est moins précise en raison du manque d’homogénéité du marquage GFP.

Bleu : Détection très précise des noyaux malgré les rayures et la poussière sur le récipient

TruAI Deep Learning

Dimension + Deep Learning

Standard + Deep Learning

Découvrez les avantages de la technologie d’apprentissage profond TruAI du logiciel cellSens pour améliorer l’analyse de vos images. De la segmentation automatique de morphologies complexes sans annotation manuelle à la segmentation de cellules ou d’organites à partir d’une simple image en lumière transmise, la technologie d’apprentissage profond offre une vitesse et une efficacité accrues sans la réaction phototoxique de la fluorescence.

Explorez des exemples d’applications

En savoir plus sur TruAI

Comptage et mesure des objets

Dimension

Standard + Comptage et Mesure

Une détection d’objet efficace et précise, basée sur les seuils, permettant le comptage et la classification automatisés des noyaux, est disponible. Exportez facilement vos résultats vers Microsoft Excel pour une analyse supplémentaire.

Dimension + Comptage et Mesure

Standard + Comptage et Mesure

Étendez les nombreuses mesures manuelles déjà disponibles dans le logiciel cellSens grâce au module Comptage et Mesure. Réaliser facilement une mesure et une classification d'objet automatique dans une interface interactive où les objets reconnus sont toujours associés à leurs mesures.

Dimension + Comptage et Mesure + Apprentissage profond

Standard + Comptage et Mesure + Apprentissage profond

Améliorez votre comptage et votre mesure en détectant les objets grâce à l’apprentissage profond.

https://adobeassets.evidentscientific.com/content/dam/video/video/library/cellSens_tracking-web2(2)_406.mp4

Solutions pour cellules vivantes

Dimension

Standard + Contrôleur de confluence

Notre algorithme spécialisé d’identification cellulaire vous permet de mesurer le nombre de cellules et la confluence cellulaire à l’aide d’images en contraste de phase, y compris le calcul de la moyenne des données et l’estimation du nombre total de cellules. Vous pouvez également générer une courbe de croissance cellulaire en effectuant des mesures dans une série chronologique.

Mesures d’intensité

Dimension

Représentation graphique des valeurs d’intensité et des valeurs de rapport définies par régions d’intérêt (ROI) et ajustement du placement des ROI pour compenser le mouvement cellulaire. Convertir les variations d’intensité en teinte et en luminosité à l’aide de l’affichage modulé en intensité (IMD) pour améliorer visuellement les structures fines souvent présentes dans les images de ratio ou de FRET.

Dimension + Ratio/FRET ou Life Science Analysis

La solution Ratio/FRET est utilisée pour afficher et analyser les données d’imagerie ratiométrique en temps réel. L’analyse FRET, à émission sensibilisée et par photo-blanchiment de l’accepteur, est prise en charge dans ce flux de travail intuitif et convivial pour l’utilisateur.

Dimension + Analyse des sciences de la vie

La solution de photo-manipulation peut être utilisée pour l’analyse d’ajustement de courbes des images FRAP.

Expériences macro simples

Dimension

Économisez du temps et des clics en utilisant le gestionnaire de macros pour automatiser les flux de travail typiques d’acquisition et d’analyse de données. Appliquées à plusieurs images simultanément, les commandes de macros par lots peuvent réduire le temps nécessaire à l’acquisition et à l’analyse d’images complexes.

Interface utilisateur personnalisable

Choisissez une disposition recommandée pour l’acquisition d’images et l’analyse, ou créez votre propre disposition en utilisant l’ensemble d’outils My Functions.

Intuitif, peu importe le niveau de compétence

Dimension

Standard

Novices ou experts, les utilisateurs bénéficieront tous de l’interface Simple Layout, laquelle a été conçue pour le flux de travail en recherche clinique.

  • Acquérez, annotez, partagez et enregistrez vos images à l’aide de la fenêtre d’outil Smooth Control intuitive.
  • Les outils de mesure intégrés ne s’affichent qu’au besoin, ce qui réduit l’encombrement dans le logiciel et minimise les distractions.

Les expériences plus complexes bénéficient de dispositions prédéfinies où toutes les fonctions courantes sont intégrées dans des onglets, regroupant les options et paramètres associés. Ces onglets de configuration permettent de sélectionner facilement des fonctions selon le flux de travaux. Par exemple, les fonctions de contrôle de la caméra s’affichent sous l’onglet Acquisition, mais sont masquées lorsque vous passez à l’étape suivante avec l’onglet Processing.

https://adobeassets.evidentscientific.com/content/dam/video/video/library/cellSens_SimpleLayout_e(2)_404.mp4

Créez votre propre disposition

Dimension

Standard

Les outils et fenêtres peuvent être organisés pour s’adapter à la tâche en cours, optimisant la fonctionnalité de la disposition. Cela vous permet de passer moins de temps à la formation et plus de temps à l’imagerie.

Vous pouvez créer et enregistrer des barres d’outils personnalisées pour les fonctions fréquemment utilisées et les sauvegarder dans la fenêtre Mes fonctions, où elles peuvent être utilisées pour améliorer l’efficacité lorsque vous travaillez avec vos outils les plus couramment utilisés.

Réduire la lueur du moniteur

Dimension

Standard

Le thème sombre de l’application réduit la lumière ambiante générée par l’écran d’ordinateur, vous aidant à vous adapter aux environnements assombris, comme ceux requis lors de l’imagerie d’échantillons en fluorescence. Le contraste des icônes reste élevé pour une reconnaissance facile et une sélection rapide.

Caractéristiques techniques

Modules du logiciel cellSens Solutions

y = inclus

O = en option

Version de base Standard Dimension
Processus manuel Créez facilement des images composites haute résolution (Instant MIA) en déplaçant simplement la platine manuelle. Vous pouvez également acquérir une image focalisée (EFI) sur l’ensemble de la surface en déplaçant manuellement l’axe Z. o o y
Dispositif codé Les dispositifs codés (objectifs, intensité lumineuse, etc.) facilitent le rappel des réglages. o y y
Mesure interactive Tracez une polyligne, un rectangle ou un cercle sur votre image pour obtenir des données de mesure exportables. Les résultats des mesures peuvent être exportés vers Excel. o y y
Database Client Accès à la base de données créée avec l’option Database Core. o o o
Database Core Optimisez la gestion et la navigation des données en créant une base de données permettant de rechercher et de trier facilement les images acquises en fonction de données telles que les conditions d’imagerie et la date d’acquisition. o o
Contrôleur de confluence Déterminer la confluence des cellules vivantes non colorées dans les boîtes de culture par des mesures quantitatives pour obtenir des données fiables. o y
Multiposition Il est possible d’acquérir des images multipoints et assemblées grâce à la platine motorisée. Lorsqu’elle est associée à l’axe Z motorisé, une carte de focalisation peut être créée à partir de plusieurs points de focalisation, et vous pouvez obtenir des images assemblées avec peu de variation de mise au point en corrigeant l’inclinaison et la distorsion de l’échantillon. o o
Compter et mesurer Définissez la morphologie d’un objet, et le logiciel identifiera tous les objets similaires et présentera les résultats de l’analyse de segmentation dans un graphique. o o
NetCam Facilite le transfert d’images en direct et stockées par l’intermédiaire d’un réseau à des fins d’enseignement, de mentorat ou de supervision. o o
Apprentissage profond Une analyse de segmentation efficace, basée sur l’apprentissage profond, permet la détection de cibles difficiles, notamment la détection de noyaux sans marquage. o o
Navigateur de plaque à puits*1 Configurez facilement les réglages de capture pour chaque puits. La position et le nom du puits peuvent être associés aux images, ce qui facilite la gestion des données et rend le criblage des plaques à puits plus efficace. o
Déconvolution CI Accès à la déconvolution basée sur GPU ainsi qu’aux algorithmes de déconvolution TruSight populaires et personnalisés pour améliorer la netteté, le contraste et la plage dynamique des images reconstruites. o
Rapport/FRET Obtenez des mesures de rapport à partir de vos images pendant leur acquisition. o
Suivi*2 Mesurer et analyser la luminance et la vitesse des cellules individuelles qui se déplacent et se divisent au fil du temps. o
Analyse des sciences de la vie L’analyse FRAP/FRET peut être réalisée sur l’image acquise. o
Manipulation de photos Permet le contrôle du module Cell FRAP et l’analyse FRAP. o
Contrôle du laser Permet au connecteur BNC NI USB-6343 de contrôler des périphériques externes. o
Bague de correction automatique (ACC) Opération du collier correcteur automatisé. o o
Super résolution pour cellSens*3 Super résolution améliorée (en ligne et hors ligne) o
* 1 Nécessite l’option Multiposition
* 2 Nécessite l’option Comptage et Mesure
* 3 Également pour ordinateur de bureau

Fonctions cellSens

✓ = inclus

- = Non inclus

Dimension Standard Version de base
Disposition Personnalisation de l’expérience utilisateur
Vue Superposer plusieurs images -
Groupes de documents pour la comparaison d’images côte à côte
Lecture de vidéo
Vue en tuiles (plusieurs images dans un seul ensemble de données affichées côte à côte)
Vue en tranche pour affichage en plan orthogonal d'ensembles de données Time-lapse ou 3D - -
Visualiseur Voxel pour isosurface et rendu volumétrique des ensembles de données 3D et 4D - -
Acquisition d’image Acquisition instantanée/vidéo
Time-lapse à intervalles spécifiés -
Multi-longueur d’ondes automatisé -
Coupes optiques - -
Multidimensionnel (XYZT et longueur d’onde) - -
Graphical Experiment Manager - -
Imagerie panoramique manuelle (MIA instantanée et MIA manuelle) Processus manuel Processus manuel
Visite multiposition et navigateur de platine Multiposition Multiposition -
Imagerie panoramique automatisée (auto MIA, nécessite une platine motorisée) Multiposition Multiposition -
Crée instantanément une image EFI (manuelle ou motorisée Z) Processus manuel Processus manuel
Imagerie multicolore simultanée (nécessite deux caméras identiques** ou un séparateur d’images) - -
Correction du flou en direct - -
Imagerie à grande gamme dynamique (HDRI) - -
Acquisition de plaque multi-puits Navigateur de plaque à puits et multiposition - -
Bague de correction automatique (ACC)
Filtre de super-résolution avec algorithme renouvelé -
Traitement des images Traitement de géométrie, de combinaison, de filtrage -
Démixage de fluorescence - -
Démixage fond clair Compter et mesurer - -
Correction du flou (Aucun/plus proche voisin, filtre de Wiener) - -
Kymographe - -
Déconvolution en 2D - -
Déconvolution 3D (déconvolution itérative contrainte avec traitement GPU) Déconvolution CI - -

Apprentissage profond

(TruAI)

Entraînement des réseaux neuronaux Apprentissage profond Apprentissage profond -
Inférence à l’aide de réseaux neuronaux entraînés (hors ligne/en ligne) Apprentissage profond ou comptage et mesure Apprentissage profond ou comptage et mesure -
Analyse d'image Analyse de phase - -
Mesures et classification d’objets Compter et mesurer Compter et mesurer -
Mesures interactives en 2D ✓*
Tracé de l’intensité dans le temps/z - -
Colocalisation - -
Décompte d’objets (manuel) -
Suivi d’objet Suivi, comptage et mesure - -
Ratio et cinétique en ligne Rapport/FRET - -
Analyse des ratios (hors ligne) - -
Analyse FRET Analyse des ratios/FRET ou analyse des sciences de la vie - -
Analyse FRAP Manipulation d’images ou analyse pour les sciences de la vie - -
Comptage cellulaire et mesures de confluence Contrôleur de confluence -
Documentation et collaboration Composer automatiquement des rapports Microsoft Word - -
Solution de gestion d’images et de données basée sur une base de données pour la microscopie Database Core Database Core -
Ouvrir la base de données et charger des enregistrements/documents à partir de la base de données Database Client Database Client Database Client
Contrôle à distance Affichage d’image en direct à distance NetCam NetCam -

* Angle à trois points, angle à quatre points, ligne arbitraire, polygone fermé, polyligne et ligne perpendiculaire uniquement. L’option de mesure interactive est requise pour ajouter d’autres outils de mesure et permettre l’exportation de feuilles de calcul Excel.

** Caméras compatibles : iXon Ultra 897, Zyla 5.5 (USB 3.0), Zyla 4.2 (USB 3.0/CamLink), Neo, iXon Ultra 888, ImagEM X2, ORCA-Flash 4.0 (V3), Prime 95B, Prime BSI, Prime BSI Express, Sona4.2B-11, Kinetix, Kinetix 22, ORCA-Fusion, ORCA-Fusion BT, ORCA-QUEST.

Produits dont la fonctionnalité est confirmée

✓ = inclus - = non inclus Dimension Standard Version de base
Olympus/Evident Caméra DP22, DP23, DP23M, DP27, DP28, DP74, DP75, DP80, XM10, UC90, LC20, LC30, LC35, SC50, SC180
Micoscope

BX43, BX53, BX63, BX61, BX61WI, IX83, IX85,

IX73, IX81, SZX16A

-
IX81-ZDC, IX81-ZDC2 - -
Périphériques BX-DSU, IX3-DSU, IX3-ZDC, IX3-ZDC2, IX2-DSU, IX2-ZDC, IX2ZDC2, U-CBF, cellTIRF (multiligne, ligne unique), convertisseur USB-ODB, contrôleur en temps réel (U-RTCE) - -
Source lumineuse U-LGPS -
Hamamatsu Caméra ImagEMX2, ORCA-Flash 4.0 V3, ORCA-Flash 4.0 LT PLUS, ORCA-Flash 4.0 LT3, ORCA-Fusion, ORCA-Fusion BT, ORCA-QUEST, ORCA-Halo* - -
ORCA-spark -
Séparateur d’image W-View Gemini - -
Q-Imaging Caméra Retiga 6000 - -
Photometrics Caméra Prime (PCI-Express), Prime 95B, Prime BSI, Prime BSI Express, Moment, Kinetix, Kinetix22 - -
Séparateur d’image Dual View DV2 / QuadView QV2 - -
Andor Caméra iXon Ultra 897, iXon Ultra 888, iXon Life 888, iXon Life 897, Sona4.2B-11,Zyla4.2/Zyla4.2 PLUS (Camera-link,USB3.0), Zyla5.5 (Camera-link 10tap,USB3.0), ZL41 Cell 4.2 (Camera-link,USB3.0), Neo5.5 - -
Vincent Associates Obturateur Obturateur Uniblitz (VCM-D1, VMM-D1, VMM-D3) -
CoolLED Light Source pE-1, pE-2, pE800, pE-4000, pE-400 max - -
pE-300white, pE-300ultra, pE-340fura -
Excelitas Source lumineuse X-Cite120LED, X-Cite XYLIS, X-Cite TURBO, X-Cite NOVEM - -
Lumencor Source lumineuse SOLA SEII, SEII 365, Spectra X - -
Sutter Obturateur, FW Lambda 10-3/10-B
Prior Platine XY motorisée ProScan III, Optiscan III Multiposition - -
Obturateur, FW, axe Z ProScan (I, II, III), Optiscan III - -
Piezo Z (contrôle par contrôleur en temps réel) NanoScanZ NZ100 - -
Ludl Platine XY motorisée Mac 6000 Multiposition - -
Obturateur, FW, axe Z Mac 6000 - -
Märzhäuser Platine XY motorisée Tango, Étape pilote Multiposition - -
Contrôleur d’axe Z Tango - -
Physik Instrumente Piezo Z (contrôle par contrôleur en temps réel) PIFOC P-721 - -
Applied Scientific Instrumetation Platine XY motorisée MS-2000 Multiposition - -
Contrôleur d’axe Z MS-2000 - -
National Instruments Périphérique TTL numérique NI USB-6501 - -
NI USB-6343 BNC Contrôle du laser - -
Yokogawa CSU CSU-X1, CSU-W1 - -
Changeur de grossissement IX SPIN-SR - -
CrestOptics CSU X-Light V3 - -

Pour plus de détails sur la compatibilité avec les systèmes d’exploitation Windows, veuillez contacter votre représentant commercial Evident.

* Non utilisable en combinaison avec d’autres caméras Hamamatsu

Formats d’image compatibles

Lecture et écriture
JPEG, JPEG2000, TIFF, BMP, AVI, PNG, VSI, PSD (Adobe Photoshop), Big TIFF, OIR
Lecture seule
GIF, OIF/OIB (format FLUOVIEW), Cell, STK (MetaMorph), MRC (Medical Research Council)

Configuration minimale requise

OS
Microsoft Windows 10 Professional (64 bits) (22H2), Microsoft Windows 11 Pro (64 bits) (24H2)
Langue du système d’exploitation
anglais, chinois simplifié, japonais, allemand et italien (Entry et Standard)
Unité centrale
Intel Core i7, Intel Core i9, Intel Xeon ; Recommandé pour une acquisition d’image haute vitesse : au moins QuadCore
RAM
8 Go pour les applications générales, 16 Go ou plus sont recommandés pour l’acquisition rapide d’images, 32 Go ou plus sont recommandés pour l’apprentissage profond (pour DP23/DP28/DP23M, une mémoire double canal est recommandée pour l’imagerie à haute cadence d’images).
HDD

Jusqu’à 7 Go pour l’installation

Recommandé pour l’acquisition d’images à haute vitesse : disque SSD (Solid State Drive)

Navigateur Web
Recommandé : Microsoft Edge

Mise à jour de la version du logiciel

Une mise à jour de version est disponible pour la version immédiatement suivante à celle figurant sur la carte de licence (à l’exclusion des mises à jour de sous-versions mineures). Une mise à jour couvrant deux versions majeures ou mineures ou plus nécessite une licence de mise à jour, qui donne accès à la dernière version du logiciel cellSens après la période ci-dessus.
Assurez-vous d’utiliser la plus récente version de votre logiciel.

Téléchargements

Programmes d’installation et outil de vérification de version

Notes de version

Version 1.7 ou ultérieure

Vérifiez la dernière version disponible pour votre logiciel

Plus

Version 4.4.1

Nouveau matériel pris en charge

·       Hamamatsu ORCA-Halo (C17440-2OU)

·       CoolLED pE-400 max

·       Excelitas X-Cite NOVEM

Nouvelles fonctionnalités et améliorations

·       Prise en charge améliorée du disque rotatif,
bague de correction automatique disponible lors de l’imagerie avec disque rotatif,
prise en charge du nouveau filtre de Wiener et de la déconvolution CI,
prise en charge des objectifs à grossissement combiné

·       Le mode de prévention du photoblanchiment peut être utilisé avec des échantillons sensibles.

·       Flux de travail du niveau macro au niveau micro avec prise en charge améliorée de la carte de mise au point

·       Mise à jour précédente du pilote : meilleure prise en charge du flux de travail avec objectif en gel de silicone

·       Exportation d’images vers scanR

Version 4.4

Nouveau matériel pris en charge

·       Changeur de grossissement Yokogawa

·       Crest X-Light V3

·       Teledyne Kinetix et Kinetix22

Nouvelles fonctionnalités et améliorations

·       L’algorithme de super-résolution renouvelé permet des calculs dans des conditions variées et offre une qualité d’image supérieure.

·       La fonction de prévisualisation en super résolution est possible avec des réglages spécifiques à chaque canal.

·       La nouvelle fenêtre de contrôle du disque rotatif permet une vue d’ensemble et une modification aisées des paramètres du dispositif

·       Activer l’optimisation de la taille de la sous-trame en fonction du numéro de champ (FN)

Version 4.3.1

Nouveau matériel pris en charge

·       Système de microscope IXplore™ IX85

·       Bague de correction motorisée (ACC)

·       Nouveaux objectifs à lentille de gel

·       Hamamatsu Photonics ORCA-Quest 2 (C15550-22UP)

Nouvelles fonctionnalités et améliorations

·       La correction de la distorsion et la correction du décalage de la caméra améliorent la qualité de l’image

·       La bague de correction motorisée permet un ajustement automatique

·       La gestion simplifiée des paramètres d’échantillonnage est intégrée au logiciel cellSens

·       Fonctionnalités d’assemblage améliorées, notamment l’alignement instantané de plusieurs images (MIA)

·       La prise en charge de la correction intelligente des ombres permet de supprimer les ombres sans étalonnage.

Version 4.3

Nouvelle fonction/amélioration

·       Prise en charge du périphérique BNC National Instruments USB-6343

o   Ajout de dispositifs Piezo Z, de volets, de sources lumineuses et de l’IX3-FRAP

·       Caméra Hamamatsu Photonics Quest

o   Le mode de résolution du nombre de photons a été ajouté.

o   La stabilité et les performances d’exposition automatique ont été améliorées

·       DP75 avec résolution 4K

o   Il est possible d’utiliser 3840x2160 (4K) pour la capture d’instantanés en direct et l’enregistrement vidéo, avec une cadence allant jusqu’à 30,0 ips.

·       Limite de résolution EFI

o   La limite de l’EFI (Extended Focus Image) a été portée à environ 12 MP (4 096 x 3 000 pixels).

·       Inférence d’apprentissage profond

o   Prise en charge d’ONNX Runtime avec DirectML pour l’inférence, et la vitesse de traitement a été améliorée pour les configurations CPU ou GPU non-NVIDIA.

Version 4.2.1

Nouveau matériel pris en charge

·       Evident DP75

·       Hamamatsu Photonics ORCA Quest

·       Andor ZL41 Cell 4.2

·       National Instruments USB-6343 BNC

Nouvelle fonction/amélioration

·       TruAI (apprentissage profond)

o   Catégoriser les options du menu déroulant de sélection du réseau neuronal

o   Possibilités de mise à l’échelle ajoutées pour l’utilisation des réseaux neuronaux

Les informations relatives au réseau neuronal et la boîte de dialogue « Gérer le réseau neuronal » ont été améliorées.

Version 4.2

Nouveau matériel pris en charge

·       Hamamatsu ORCA Flash4.0 LT3

Nouvelle fonction/amélioration

·       Étalonnage du grossissement

o   La lame d’étalonnage permet un étalonnage du grossissement partiellement automatique.

o   Le rapport d’étalonnage peut être exporté.

·       Gestionnaire d'expérience

o   La méthode d’observation, le temps d’exposition et les paramètres de la caméra peuvent être définis lors du paramétrage de l’acquisition d’aperçu, rendant l’expérimentation plus efficace.

o   Le paramètre de détection d’échantillon dans le Stage Navigator peut être facilement appliqué à d’autres expériences.

o   Le traitement de déconvolution 2D/3D est disponible pendant l’expérience.

·       TruAI (apprentissage profond)

o   La fonction de régression d’image permet la création d’images présentant un bon rapport signal/bruit.

o   La fonction d’entraînement interactif rend l’entraînement plus efficace.

o   Amélioration de la traçabilité des protocoles expérimentaux grâce à la possibilité d’identifier les informations réseau utilisées

o   Ajouter un réseau neuronal pour la segmentation « Classification des noyaux IHC ».

·       Transparence de la barre d’échelle

·       Amélioration de la rotation de la vue en mode direct.

·       L’exportation des images multicanaux a été améliorée pour permettre l’exportation simultanée de chaque canal et de l’image fusionnée.

·       Ajouter une nouvelle méthode pour le MIA hors ligne.

·       Accès simplifié au logiciel FLUOVIEW.

Le comptage d’objets est disponible dans cellSens Entry.

Version 4.1.1

Nouveau matériel pris en charge

·       Les modèles de type 2 pour DP23, DP23M et DP28 sont désormais pris en charge.

·       Remarque : Vous pouvez trouver le numéro de révision matérielle des caméras DP23 et DP28.

·       (Rév. 1 ou Type 2) sur la plaque signalétique de la caméra.

Corrections mineures de bogues

·       Ajustement des bordures des images MIA à partir du Gestionnaire de processus.

·       Chargement des paramètres pour Well Navigator

·       Valeurs de corrélation en colocalisation

·       Stabilité de l’étalonnage de la correction d’ombrage

Version 4.1

Nouveau matériel pris en charge

·       Teledyne Photometrics :Prim BSI Express (haute sensibilité sCMOS)

·       CoolLED :pE800 (source lumineuse LED à 8 canaux)

Nouvelle fonction/amélioration

·       « Détection automatique d’échantillons » dans le Stage navigator.

o   Les algorithmes « génériques » et « IA » sont disponibles pour définir les zones de multi-imagerie.

·       « Acquisition d’aperçu » dans Experiment Manager

o   Au début de l’expérience, l’image d’ensemble peut désormais être capturée et la détection des échantillons peut être effectuée automatiquement à l’aide de la fonction « Détection automatique d’échantillons ».

o   L’imagerie « Macro à micro » est disponible.

·       Amélioration de TruAI (fonction d’apprentissage profond)/

o   Ajout de la nouvelle segmentation d’instance. Case à cocher « Objets individuels » dans la classe d’étiquettes d’entraînement. Les objets qui se chevauchent peuvent être séparés individuellement.

o   Réseau neuronal pré-entraîné pour la détection des noyaux et des cellules dans l’option complète Comptage et mesure de cellSens et dans l’option d’apprentissage profond.

o   Des GPU supplémentaires NAIDIA RTX3080, RTX A4000 sont pris en charge.

·       Amélioration de la correction de l’ombrage

o   Un algorithme « spécial » est disponible.

o   Le « filtre de lissage » peut être utilisé dans l’étalonnage standard.

·       Amélioration de la déconvolution

o   L’algorithme « 2D no neighbor » peut être utilisé dans le défloutage en ligne.

o   Les GPU supplémentaires NVIDIA RTX3060i, RTX3070, RTX3080 et RTX A4000 sont pris en charge.

o   Les fichiers journaux relatifs à la déconvolution sont inclus dans la section « Informations d’assistance client ».

·       Enregistrer l’étalonnage des pixels dans une image JPEG

o   Enregistrez et ouvrez l’étalonnage des pixels avec l’image JPEG.

o   Mesure de la longueur et de la surface dans les images JPEG.

·       La création d’étiquettes d’entraînement est possible avec tous les packages cellSens.

·       Nouvel écran de démarrage harmonisé avec les autres logiciels.

·       La nouvelle politique de mise à jour.

·       Les licences de mise à jour ont été renommées OUT (One Time Update).

Version 3.2

Nouveau matériel pris en charge

·       Olympus : U-LGPS LED et source de lumière LDP

·       Teledyne Photometrics : Caméra scientifique CMOS à obturateur global Moment

Nouvelle fonction/amélioration

·       Amélioration de TruAI (fonction d’apprentissage profond)

o   La taille minimale des images pour les fichiers d’entraînement est de 512x512.

o   En plus des images VSI, les images TIFF peuvent également être utilisées pour l’entraînement.

o   Le nombre de fichiers image utilisés pour l’entraînement est affiché dans les paramètres d’entraînement.

o   Le « mode basique » et le « mode expert » pour des réglages plus détaillés sont sélectionnables pour l’entraînement.

o   D’autres types de réseaux neuronaux sont disponibles pour l’entraînement.

o   Plusieurs types de paramètres de durée d’entraînement sont disponibles.

o   Le point de contrôle peut être défini à tout moment dans les paramètres d’entraînement.

o   L’affichage en direct des résultats d’inférence est possible et ces résultats peuvent être confirmés avant l’acquisition de l’image.

o   L’inférence d’apprentissage profond et le comptage des objets peuvent être exécutés simultanément

o   L’outil Magic Wand est disponible pour annoter les images d’entraînement.

o   Dans le cas du traitement d’images Z-stack, les résultats de l’inférence sont affichés pour chaque plan.

o   Les informations relatives au traitement par réseau neuronal sont affichées sur les propriétés des images traitées.

o   Des cartes graphiques supplémentaires NVIDIA RTX3060Ti et RTX3070 sont désormais prises en charge.

·       Une fonction permettant de restaurer l’état cellSens vers un point de restauration spécifié est disponible (information publique uniquement).

·       Le processus de récupération des données peut être activé ou désactivé. En cas de « désactivation », le temps total d’acquisition des données peut être réduit sans le traitement de récupération des données, ce qui est particulièrement avantageux pour l’acquisition de grands volumes de données.

·       La période de collecte des journaux peut être spécifiée.

·       L’exécution de la macro peut être configurée dans le « Graphical Experiment Manager ». La macro est exécutée juste après la fin de l’acquisition (traitements spécifiques uniquement).

·       D’autres options d’exportation d’images sont disponibles.

o   Données brutes et canaux fusionnés : l’image de chaque canal et l’image fusionnée sont exportées.

o   Données brutes et canaux fusionnés avec informations intégrées : l’image de chaque canal et l’image fusionnée sont exportées, les informations sont inscrites de façon permanente.

·       Amélioration de la compatibilité de la fonction NetCam avec son environnement fonctionnel

·       Amélioration de la fonction de recadrage d’image

o   Les images acquises peuvent être recadrées en spécifiant numériquement la position XY et la taille.

o   La zone ROI peut être enregistrée comme une nouvelle image.

·       Les sources lumineuses LED CoolLED pE-300 white et pE-300 ultra sont prises en charge dans cellSens Standard

Version 2.3

Nouveau matériel pris en charge

·       Hamamatsu : Caméra CMOS scientifique ORCA-Fusion

·       CoolLED : pE-300white, pE-300ultra, pE-340fura source lumineuse LED

·       Andor : Caméra CMOS scientifique Sona 4.2B-11

Nouvelle fonction/amélioration

·       Prise en charge de la caméra CMOS Hamamatsu ORCA-spark par cellSens Standard

·       Amélioration du MIA automatisé

o   Acquisition d’une image d’ensemble multicolore

o   Définir la zone MIA par un polygone

o   Sélection de la couleur de fond

·       Sélection manuelle de « Extract Best Focus » (mode de sélection personnalisée)

·       Amélioration du profil de ligne

o   Polyligne et main levée

o   Plusieurs lignes dans une seule image

·       Fonction zoom en mode d’affichage mosaïque

·       Amélioration de l’algorithme de calcul de la déconvolution 3D

Version 2.1

Nouveau matériel pris en charge

·       Hamamatsu ORCA FLASH LT PLUS

Changements du portefeuille de produits

·       La caméra haut de gamme est supprimée et intégrée à Dimension

·       L’appareil haut de gamme est supprimé et intégré à Dimension

·       L’acquisition multicolore a été supprimée en tant que fonctionnalité distincte et est désormais intégrée à Standard

·       Trois nouvelles solutions pour Entry

o   Processus manuel : activer MIA manuel et EFI manuel

o   Encodé : activer le contrôle des dispositifs codés

o   Mesure interactive : activer l’exportation des résultats de mesure vers Excel

Nouvelle fonction/amélioration

·       Traitement GPU pour la déconvolution CI

·       Prise en charge des propriétés de groupe de positions pour le nommage et l’enregistrement automatiques

·       Améliorations apportées à la boîte de dialogue Exporter l’image, notamment les suivantes : fusion des canaux, incrustation des informations et séparation des canaux.

·       Enregistrer au format OIR

·       Importer une image au format OME-TIFF

·       Conversion par lots

·       Ajuster la résolution d’impression (PPI) des images

·       Exécuter la macro de correction d’ombrage dans FV3000

·       Sélectionner tous les objets détectés dans Comptage et mesure

·       Commande EFI dans le gestionnaire d’expériences

·       Masquer l’alerte lors du changement de périphérique manuel

Ressources

Analyses

Ressources produit

Videos