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공초점 현미경 혁신
FLUOVIEW Smart™ 소프트웨어: 직관적이고 AI로 강화된 워크플로를 도입
공초점 레이저 주사 현미경은 생명과학 및 의학 연구에서 필수적인 도구로 자리매김했으며,고해상도 관찰과 3차원 분석을 세포와 조직과 같은 생물학적 시료에 대해 가능하게 합니다.
이들은 세포 생물학, 신경과학, 그리고 발달 생물학 등 다양한 분야에서 널리 사용되며, 이는 연구의 품질과 재현성을 지원하는 기초 기술로 자리잡고 있습니다.
다양한 연구 요구를 충족하기 위해 공초점 현미경은 점점 더 진보된 기능과 더 높은 이미징 유연성을 제공하도록 발전해 왔습니다. 그러나 이러한 발전으로 인해 소프트웨어 인터페이스가 더욱 복잡해져, 특히 초보 사용자에게는 설정에 시간이 많이 걸리고, 운영상의 오류 위험이 높아지며, 연구 워크플로의 효율성이 저하되는 등 상당한 어려움이 발생했습니다.
복잡한 공초점 소프트웨어
인터페이스가 제기하는 과제
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습득 난이도 높음: 작동을 익히는 데 상당한 시간이 소요되어 연구 시작이 지연됩니다. 초보자는
시작점을 파악하지 못해 숙련된 사용자나 지도자의 도움을 자주 받게 됩니다.
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오작동으로 인한 효율성 저하: 설정이 많고 기능을 찾기 어렵기 때문에 작업 흐름이 분절됩니다.
오류로 인해 데이터가 손실되거나 샘플이 손상되어 비용이 많이 드는 재이미징이나 재실험이
필요할 수 있습니다.
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공유 환경의 문제: 다양한 경험 수준을 가진 여러 사용자가 동일한 시스템을 공유하는 경우, 눈에
띄지 않게 설정이 변경되어 의도치 않은 영상 조건이 발생하고, 샘플이 낭비되며 실험을 반복해야
할 수도 있습니다.
이러한 문제를 해결하려면 직관적이고 간소화되었으며 사용자 워크플로를 중심으로 설계된 소프트웨어 인터페이스가 필요합니다.
FLUOVIEW Smart™ 공초점 소프트웨어를 사용한 사용자 경험 최적화
Evident의 FLUOVIEW Smart 공초점 소프트웨어는 초보자부터 전문가까지 모든 사용자가 FLUOVIEW™ FV5000 레이저 스캐닝 현미경을 쉽게 그리고 효율적으로 운용할 수 있도록 설계되었습니다. 이 소프트웨어는 운영 부담을 줄이고 연구 생산성및 재현성을 높이기 위해 세 가지 주요 접근 방식을 사용합니다.
학습 부담을 줄이기 위한 그래픽 사용자 인터페이스 (UI) 및 화면 안내
Z 범위 설정이나 대물렌즈 선택과 같은 기본 현미경 조작은 단순한 설정이 아니라, 현재 시스템 상태를 파악하기 위한 필수 정보입니다.
FLUOVIEW Smart는 이러한 설정을 그래픽적으로 시각화하여 사용자가 그 의미와 영향을 직관적으로 이해할 수 있도록 합니다(그림 1 및 2 참조).
화면상의 가이드는 사용자가 혼란 없이 작업을 수행할 수 있도록 돕고, 지속적인 감독의 필요성을 줄이며 자율적인 데이터 수집을 가능하게 합니다.
그림 1. Z-범위 설정 화면. 이미징의 시작 및 종료 위치와 현재 관찰 위치가 한눈에 명확하게
표시됩니다.
그림 2. 대물렌즈 선택 화면. 사용자는 원하는 대물렌즈를 직관적으로 선택할 수 있으며, 현재 활성화된 렌즈를 쉽게 식별할 수 있습니다.
기능적 우선순위에 따른 레이아웃
모든 기능을 하나의 화면에 밀어 넣는 대신, FLUOVIEW Smart™ 소프트웨어는 빈도와 중요도에 따라 계층적으로 구성합니다. 레이저 출력, 스캔 범위, Z-스택 설정과 같은 중요한 제어 기능은 항상 쉽게 접근할 수 있으며, 자연스러운 워크플로(샘플 감지 → 조건 설정 → 이미징)와 일치합니다. 이러한 디자인은 검색 시간을 최소화하고 오류 위험을 크게 줄여줍니다.
재설정 및 목적 기반 자동 레이아웃
공유 환경에서의 문제를 방지하기 위해, FLUOVIEW Smart 소프트웨어는 시작 시 설정을 기본값으로 초기화합니다. 동시에 사용자는 실험의 재현성을 위해 이전 설정을 저장하거나 불러올 수 있습니다. 또한 이미징 목적(예: Z-스택, 타임랩스, 다중 영역 스티칭) 을 선택하면 레이아웃과 화면 안내가 자동으로 조정되어 초보자와
전문가 모두에게 최적의 인터페이스를 제공합니다(Figure 3).
그림 3. 목적 선택 화면 선택한 목적에 따라 레이아웃과 화면 안내가 자동으로 조정됩니다.
초보자를 위한 AI 기반 지원
인터페이스를 단순화하는 것뿐만 아니라, FLUOVIEW Smart™ 소프트웨어는 AI를 활용하여 초보자에게 특히 어려운 단계들을 자동화하고 최적화합니다.
자동 샘플 감지
공초점 현미경의 광학 원리로 인해 샘플이 XY 또는 Z 방향에서 초점이 맞지 않으면 화면이 비어 있는 것처럼 보일 수 있으며, 초보 사용자는 문제가 설정 때문인지 하드웨어 오작동 때문인지 확신할 수 없습니다.
이 문제를 해결하기 위해, Evident와 Epistra는 생명과학 분야에서 입증된 AI 개발 전문성을 바탕으로, 샘플 탐색에 최적화된 상태로 현미경을 자동으로 전환하고 샘플 영역을 자동으로 인식하는 이미지 인식 알고리즘을 공동으로 개발했습니다. 이로 인해 이전에는 초보자에게 어려웠던 과정이 크게 간소화되고 가속화됩니다(그림 4).
Figure 4. 공초점 레이저 주사 현미경에서 샘플 검색의 높은 어려움으로 인해 빈 화면(오른쪽 이미지)이 발생할 수 있습니다.
Figure 5는 샘플 위치 추정의 전반적인 워크플로를 보여줍니다.
시스템은 전문가 사용자의 접근 방식을 모방하도록 설계되었습니다: 저배율 대물렌즈(4X)를 사용하여 Z축과 XY축을 거칠게 정렬한 후, 고배율 렌즈(10X)를 사용하여 정밀하게 조정합니다.
구체적으로, 시스템은 최적의 샘플 위치를 자동으로 결정하기 위해 다음 네 가지 단계를 순서대로 실행합니다.
Z-검색(4X)
이 단계에서는 4X 대물렌즈를 사용하여 탐색 범위 내에서 최적의 Z 위치를 대략적으로 식별하기 위해 순차적 검색을 수행합니다. 각 후보 Z 위치에서 이미지가 캡처되고 AI가 초점 점수를 평가합니다. 이 결과를 바탕으로 시스템은 다음에 탐색할 Z-위치를 자율적으로 업데이트하며, 가장 높은 초점 점수를 가진 위치에 도달할 때까지 이 과정을 반복합니다. Z-검색 범위는 마법사에서 사용자의 선택에 따라 적절히 설정됩니다.
XY-검색(4X)
4X 대물렌즈로 얻은 이미지를 사용하여 XY 스테이지를 이동시켜 가장 국소적으로 밝은 영역이 화면 중앙에 오도록 합니다. 이 과정 전에 시스템은 미리 정의된 아티팩트(예: 컨테이너 가장자리)를 감지합니다. 아티팩트가 감지되면 경고가 표시되고 프로세스가 중지됩니다. 사용자는 필요에 따라 샘플의 XY 위치를 수동으로 조정할 수 있습니다.
Z-검색(10X)
10X 대물렌즈로 전환한 후, 시스템은 순차적 검색을 수행하여 범위 내에서 최적의 Z 위치를 결정합니다. Z-검색 범위는 4X에서 확인된 최적의 Z-위치와 4X 렌즈의 Z-해상도를 기준으로 결정됩니다.
XY-검색(10X)
10X 이미지에서는 XY 스테이지를 움직여 가장 높은 국부 밝기를 가진 영역이 화면 중앙에 오도록 합니다. 이 과정이 완료되면 시스템은 현재 현미경 이미지를 사용자에게 표시하여 탐색 절차를 완료합니다.
그림 5. 샘플 위치 추정의 전체 워크플로:
Z-탐색(4X)
- 공초점 조리개를 열어두고 Z축을 따라 표본을 대략적으로 스캔합니다.
- 공초점 조리개를 1 Airy 단위로 설정하고 Z 위치를 미세 조정하여 최적의 초점을 맞춥니다.
XY-탐색(4X)
- AI 이상 감지(표본 미검출 또는 커버 유리/웰 가장자리 검출 시).
- 스테이지를 시료의 밝은 부분으로 이동하세요.
- 지도에 4X 이미지를 표시하세요.
Z-탐색(10배)
- 공초점 조리개를 열어두고 Z축을 따라 표본을 대략적으로 스캔합니다.
- 최적의 초점을 위해 1 Airy 유닛 공초점 조리개로 Z 위치를 미세 조정합니다.
XY-탐색(10배)
- 스테이지를 시료의 더 밝은 지점으로 이동합니다.
영상 조건 최적화
기존의 공초점 레이저 주사 현미경에서는 검출기 감도와 레이저 출력 사이에 본질적인 상충 관계가 존재하여 최적의 설정을 찾기 위해 시행착오가 필요합니다. 초보자들은 감도를 높이면 노이즈가 증가하고, 레이저 출력을 높이면 샘플이 손상될 위험이 있다는 딜레마에 자주 직면합니다(그림 6). 결과적으로 적절한 영상 조건을 결정하는 데 많은 시간이 소요될 수 있습니다.
Evident는 독자적인 차세대 SilVIR™ 감지기 기술로 이 문제를 해결하여 감지기 감도를 조정할 필요가 없습니다. 이를 통해 사용자가 구성해야 하는 매개변수 수가 줄어들어 작업이 간소화됩니다. 따라서 적절한 대비를 달성하기 위해 레이저 출력을 설정하는 것이 이미지 품질에 영향을 미치는 가장 중요한 요소가 됩니다.
FLUOVIEW Smart™ 소프트웨어는 실시간 이미지 분석과 머신 러닝 예측을 기반으로 최적의 레이저 출력을 자동으로 결정합니다. 사용자는 샘플 손상 최소화와 대비 극대화 중 우선순위에 따라 모드를 선택하여 자신의 필요에 맞는 설정을 쉽게 적용할 수 있습니다.
레이저 출력이 너무 높음
너무 높은 레이저 출력은 높은 광독성을 초래합니다.
그림 6. 레이저 출력과 이미지 품질 간의 트레이드오프
레이저 출력 부족
너무 낮은 레이저 출력은 노이즈가 많은 이미지를 생성합니다.
전반적인 과정은 다음과 같습니다:
모드 선택
사용자는 샘플 보호와 이미지 대비 중 어느 쪽을 우선시할지에 따라 Gentle, Balanced 및 Quality 세 가지 모드 중 하나를 선택합니다.
자동 레이저 출력 조정
사용자가 실행 버튼을 클릭하면 시스템이 최적의 레이저 출력을 자동으로 설정하고 프로세스를 완료합니다. 실행 중에 다음 단계가 내부적으로 발생합니다:
- 네 개의 이미지는 서로 다른 레이저 출력에서 캡처됩니다.
- 각 이미지에 대해 시스템은 AI 점수를 계산합니다. 이미지 품질의 지표(그림 7의 1~3단계). AI 점수가 표시되고, 그래프와 선택된 모드를 기반으로 시스템은 최적의 레이저 출력을 추정합니다(그림 7의 단계 4).
도 7. 다음 단계로 설명되는 레이저 전력 추정의 개념: 1: AI를 사용하여 원시 이미지에서 깨끗하고 노이즈가 적은 이미지를 예측합니다. 예측된 이미지와 원시 이미지를 비교합니다.
3. 상관 계수를 계산합니다(AI 점수:). 높은 점수는 노이즈가 적고 안정적이며, 낮은 점수는 노이즈가 많고 불안정합니다. 4. 선택된 모드에 따라 최적의 레이저 출력을 추정합니다.
참고: AI 점수는 이미지 신호 대 잡음비(SNR)와 비슷하지만 약간 다릅니다. 점수는 레이저 파워가 증가함에 따라 높아지며, 이는 노이즈 감소로 인한 이미지 품질 향상을 반영합니다.
AI 점수 곡선의 평탄 구간은 적절한 레이저 전력 설정을 나타냅니다:
이 구간에서는 레이저 파워를 추가로 높여도 이미지 품질의 개선 효과가 거의 없어 비효율적입니다.
결론
FLUOVIEW Smart™ 공초점 소프트웨어는 FLUOVIEW™ FV5000 레이저 스캐닝 현미경의 사용자 인터페이스를 간소화하고, AI 기반 기술을 활용하여 워크플로우를 향상시킵니다(그림 8).
- 복잡한 소프트웨어 인터페이스는 초보 사용자에게 큰 장벽이 됩니다.
- 간소화는 기능의 우선순위 지정, 워크플로우 기반 운용 설계 및 그래픽 사용자 인터페이스(GUI)를 통해 달성됩니다.
- AI는 샘플 감지와 레이저 출력 조정을 자동화하여 운용의 복잡성을 크게 감소시킵니다.
사용자 경험 중심의 소프트웨어 인터페이스와 AI 기반 스마트 지원 기능을 결합함으로써, FLUOVIEW Smart 소프트웨어는 초보자도 짧은 시간 안에 고품질 이미지를 획득할 수 있도록 하여 연구 환경에서 생산성과 재현성을 크게 향상시킵니다.
그림 8.AI 지원 워크플로를 통한 공초점 현미경 관찰 간소화.