ホールスライドスキャニングへのTruAI™ディープラーニング応用事例

TruAI™ディープラーニングテクノロジーにより、SLIDEVIEW™ VS200リサーチデジタルスライドスキャナーの自動化をより一層進める事が可能になりました。これにより、画像取得はますます効率的になり、必要な手間と労力を格段に抑えることが出来ます。

Maria Ada Prusicki

Maria Ada Prusicki

18 August, 2022

Wei Juan Wong

Wei Juan Wong

18 August, 202

自動サンプル検出精度の向上

サンプルマスクを計算する従来のスキャンシステムのアルゴリズムでは、高コントラストではっきり染色されたサンプルについては良好な結果が得られます。しかし、非染色や淡く染色された難度の高いサンプルについては、結果が正確でないことがよくあります。生物プレパラートには本来ばらつきがあり(色の強さの違いなど)、これが自動サンプル検出の結果に影響を及ぼす場合もあります。

以下のビデオで、通常検出と人工知能(AI)自動検出の違いをご覧ください。

適切にトレーニングされたニューラルネットワーク(NN)を用いると、TruAIディープラーニングテクノロジーによって精度の高いサンプルマスクが生成されるので、画像取得を始める前に手動で調整する必要はまったくありません。ニューラルネットワークをトレーニングすれば、難易度の高いサンプルや検出しにくい対象オブジェクトの問題を克服できます。TruAIモードでは、形態的外観に基づいて、サンプルのサブ領域を選択的にスキャンすることもできます。

AIによるサンプル検出が精度の向上とワークフローの簡易化に寄与している様子は、以下のビデオでご覧ください。

AIによるスライドスキャンワークフローの最適化

このビデオで取り上げた自動検出の対象オブジェクトは膵島でしたが、カスタムトレーニングされたニューラルネットワークでは、どのような対象オブジェクトでも検出できます。

自動スライドスキャンプロセスにTruAIディープラーニングテクノロジーを使用すれば、特に以下のような点でワークフローを改善することが可能です。

ニューラルネットワークの事前トレーニング方法

カスタマイズされたニューラルネットワークを事前トレーニングするには、いくつかの方法があります。Detect and Deep Neural Networkモジュールを備えたオプションのVS200-Desktopソフトウェアを使用することも、cellSens™などの互換性のあるソフトウェアでトレーニングされたニューラルネットワークをインポートすることもできます。最新のVS200システムでは、無償のOlyVIA™ソフトウェアを使用して、トレーニング用にラベルを指定することもできます。これによって、ニューラルネットワークのトレーニングデータの増強に寄与する同僚や生徒を増やして、結果の精度をさらに向上させることができます。